A Prof. Dr. Vágvölgyi Csaba vezette SZTE TTIK Mikrobiológiai Tanszék évtizedek óta folytat kutatásokat a mikrobiológiai alapú növényvédelem területén. Elsősorban az intenzív mezőgazdasági gyakorlat használta xenobiotikumok (pl. peszticidek) környezet- és egészségkárosító hatása miatt növekszik az igény a környezetbarát mikrobiológiai alapú technológiák alkalmazására. A tanszék kutatói jelentős eredményeket értek el az iparszerű gombatermesztésben és a különböző zöldségkultúrák (hidroponikus és szabadföldi termesztés) védelmére használható bakteriális, illetve mikroszkópikus gomba-alapú biokontroll eljárások kidolgozásában.

A környezetmikrobiológia területén kutatásokat folytatnak a környezetben felhalmozódó pesz- ticideket, illetve veszélyes bomlási intermedierjeiket semlegesítő bioaugmentációs eljárások mikrobiális hátterének kidolgozására. Nemzetközi együttműködés keretében új, innovatív mikrobiális alapú készítmények fejlesztése folyik, amelyek egyebek mellett segíthetik a biztonságosabb élelmiszertermelést és a környezetben található szennyező vegyületek szintjének csökkentését.